WebGL nalazi primenu svuda gde i standardna (desktop) grafika: igre, modeliranje, vizualizacije i slično. S obzirom da je namenjen za rad u online okruženju može se pretpostaviti da bi najveću primenu mogao pronaći u oblastima gde je ciljna grupa prosečan korisnik.
Na primer, naučnici van sfere informatike koji koriste aplikacije u kojima se služe 3D modelima (biologija, hemija, ekonomija...) čine malu stručnu korisničku grupu i mnogim situacijama njima nije neophodno online okruženje.
S druge strane prosečni korisnici online zajednice mogu biti zainteresovani za 3D alikacije koje se izvršavaju u browser-ima i koje se lako pokreću (ne zahtevaju pokretanje posebnih aplikacija) i nude popularne aspekte društvenog online okruženja (deljenje, interakcija). Primeri ovakvih aplikacija bi bile online 3D igre, virtuelne turističke ture, 3D štampа, mapiranje, telemedicina i slično. Stoga smatram da poboljšanje 3D grafike dostupne na internetu može dovesti do proširenja njene primene.
Neki od reprezentativnih primera primene WebGL-a su: